創始については不明であるが、三大実録（全国の神社を収録した901年に完成した書物）に掲載されていることから、1100年以上経過しているものと推定されます。明治28年の船津大火により類焼し、明治30年に現在地に移されました。毎年4月第4土曜日に執り行われる例祭（神岡祭）の時のみ公開される大神輿は、弘化2年（1845年）に造られたもので、船津大火以前のものである。